При ввозе товаров для принципала агент не регистрирует таможенную декларацию в книге продаж.
В письме от 07.03.2017 № 03-07-08/12793 Минфин России разъяснил вопросы регистрации таможенной декларации агентом, который покупает импортный товар для принципала и производит его таможенное оформление.
Финансисты указали, что в книге продаж счета-фактуры регистрируются тогда, когда существует обязанность исчислить НДС (п. 3 Правил ведения книги продаж, утв. постановлением Правительства РФ от 26.12.2011 № 1137, Постановление).
Если агент приобретает товар и передает его принципалу, НДС исчислять не нужно, поэтому таможенные декларации в книге продаж агент не регистрирует.
Регистрировать таможенную декларацию в журнале полученных и выставленных счетов-фактур также нет необходимости в силу п. 15 Правил ведения журнала учета полученных и выставленных счетов-фактур (утв. Постановлением). Однако их следует хранить не менее четырех лет с даты последней записи в журнале.
Подробнее о НДС при импорте см. в справочнике "Налог на добавленную стоимость".