В письме от 06.07.2016 № ЕД-4-15/12070 ФНС России рассмотрела вопрос, можно ли для подтверждения обоснованности применения нулевой ставки НДС при экспорте товаров на территорию государств-членов ЕАЭС вместо счета-фактуры и товарной накладной представить в налоговый орган универсальный передаточный документ со статусом "1" (далее – УПД).

Налоговое ведомство разъяснило, что согласно действующему порядку для подтверждения обоснованности применения нулевой ставки НДС в налоговый орган представляются документы, перечисленные в п. 4 Протокола о порядке взимания косвенных налогов и механизме контроля за их уплатой при экспорте и импорте товаров, выполнении работ, оказании услуг (Приложение № 18 к Договору о ЕАЭС).

Представление счета-фактуры и товарной накладной данным пунктом не предусмотрено. Следовательно, в составе подтверждающих документов они не подаются.

Однако, поскольку у экспортера сохраняется обязанность выставлять покупателю счет-фактуру на основании п. 3 ст. 169 НК РФ, а также первичный документ на основании ст. 9 Федерального закона от 06.12.2011 № 402-ФЗ "О бухгалтерском учете", то при реализации товаров на экспорт он вправе выставлять УПД, т.к. эта форма рекомендована ФНС России и, следовательно, при его оформлении требования п. 3 ст. 169 НК РФ считаются выполненными.

Ранее ФНС России высказывала аналогичную точку зрения (письмо от 04.04.2016 № ЕД-4-15/5702).

Подробнее о документальном подтверждении экспорта в страны ЕАЭС см. в справочнике "Налог на добавленную стоимость".