В бухгалтерском учете услуги банка относятся к прочим расходам, в целях налога на прибыль - обычно к внереализационным расходам.
Большинство банковских услуг НДС не облагаются, соответственно, налог к вычету по ним не принимается. Услуги банков, которые не отнесены НК РФ к освобожденным от НДС операциям, облагаются НДС, соответственно, налог к вычету по ним принимается в общеустановленном порядке.
О том, как в программе "1С:Бухгалтерия 8" отразить расходы на услуги банка (с НДС или без НДС), см. в обновленных статьях "Справочника хозяйственных операций. 1С:Бухгалтерия 8":