Денежные средства, полученные и возвращенные по кредитному договору, не включаются в состав доходов и расходов ни в бухгалтерском, ни в налоговом учете. Проценты по полученному кредиту учитываются обособленно от основной суммы кредита.
В бухгалтерском учете проценты включаются в стоимость инвестиционного актива, если полученный кредит связан с сооружением (изготовлением) этого актива, или в состав прочих расходов во всех остальных случаях.
В налоговом учете проценты по долговым обязательствам любого вида (в том числе инвестиционного) включаются в состав внереализационных расходов.
О том, как в программе "1С:Бухгалтерия 8" отразить операции по получению и погашению кредита, на приобретение (создание) инвестиционного актива, а также начислению и уплате процентов по нему, см. в статье "Справочника хозяйственных операций. 1С:Бухгалтерия 8":