Доходы физлица, не являющегося налоговым резидентом РФ, облагаются по ставке 30% (п. 3 ст. 224 НК РФ).

Если в текущем году сотрудник находится на территории РФ (в т.ч. с учетом календарных дней предыдущего года) 183 календарных дня или более, значит, он приобрел статус налогового резидента РФ и этот статус до окончания года уже не изменится (п. 2 ст. 207 НК РФ).

Следовательно, НДФЛ с дохода этого физлица нужно удерживать по ставке 13% (п. 1 ст. 224 НК РФ). Ставка 13% применяется ко всем выплатам в пользу сотрудника в текущем году нарастающим итогом, то есть к суммам, начисленным:

• с января текущего года и до месяца изменения налогового статуса;
• с месяца, в котором произошла смена налогового статуса, и до окончания года.

Поскольку с выплат, начисленных с января текущего года, НДФЛ уже был удержан и уплачен по ставке 30%, налог нужно пересчитать и разницу зачесть в счет предстоящих платежей по НДФЛ в отношении этого физлица.

Минфин России в письме от 27.02.2018 № 03-04-06/12086 уточнил, что зачет осуществляется только в пределах календарного года, в котором изменился статус физлица.

Как ранее пояснили специалисты ведомства, если часть НДФЛ не удалось зачесть, то за возвратом остатка налога плательщик должен самостоятельно обращаться в инспекцию по месту жительства или пребывания (см. письмо Минфина России от 26.09.2017 № 03-04-06/62127).

Подробнее о пересчете НДФЛ в ситуации, когда работник в середине года приобрел статус резидента, см. справочник "Налог на доходы физических лиц".